Existen líneas de crédito específicas con garantías del FOGAR impulsadas por el Ministerio de Economía que en varias oportunidades fueron elaboradas en articulación con otras áreas del Estado. La mayoría forma parte de programas de política económica más amplios y suelen tener algunos beneficios adicionales como bonificaciones de tasa de otros fondos fiduciarios nacionales.

Entre los programas más destacados se encuentran Microempresas Productivas para monotributistas productivos, Asistencia al Trabajo y a la Producción (ATP), que consistió en diversas líneas de crédito para el pago de sueldos garantizadas hasta el 100%, y la línea de Pequeños Contribuyentes y Autónomos (PCA 2020) que tuvo como objetivo mejorar el acceso al crédito a monotributistas y autónomos.