Presidencia de la Nación

Aporte del WGS (Whole Genome Sequencing) para el estudio de reordenamientos en virus segmentados


Disertante

Juan Degiuseppe

Resumen

Los rotavirus del grupo A son los principales agentes etiológicos de diarrea aguda en los menores de 5 años. Su genoma está compuesto por once segmentos de RNA de doble cadena, rodeado por una triple cápside proteica. Esta naturaleza segmentada le permite experimentar fenómenos de reordenamiento intergénico en condiciones de coinfección con dos o más cepas de rotavirus. Convencionalmente, los rotavirus del grupo A se clasifican de acuerdo a la caracterización molecular de los genes que codifican para las proteínas de la capa externa de la cápside (VP7 y VP4, para el G y el P tipo, respectivamente). A partir del año 2008 se propuso un nuevo sistema de clasificación basado en la caracterización de los 11 segmentos. Esta herramienta ha demostrado ser de utilidad para evaluar las relaciones evolutivas entre las diferentes cepas, el seguimiento de los eventos de reordenamiento y entender los orígenes de rotavirus poco comunes. El objetivo del presente seminario es describir la utilización de esta herramienta para analizar cepas de rotavirus seleccionadas, que fueron detectadas en nuestro país, en el contexto de la vigilancia epidemiológica que realiza el Laboratorio de Gastroenteritis Virales del INEI-ANLIS “Dr. Carlos G. Malbrán”.

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