En el ámbito ferroviario la JST investiga cualquier suceso que esté relacionado con la circulación de un vehículo que produzca tanto muerte como lesiones graves a las personas y daños graves al material rodante, la infraestructura ferroviaria y al ambiente. Además, también intervendrá en caso de colisión o descarrilamiento, como así también incendio,derrame en el material rodante o en la infraestructura ferroviaria, siempre que todos ellos sucedan dentro del territorio de la República Argentina. Una vez concluido el proceso de investigación y análisis del suceso, la JST realiza el control de las medidas de seguridad operacional implementadas.