El predio, asignado en uso y administración al Servicio de Hidrografía Naval (Ministerio de Defensa), tiene 418 hectáreas y se encuentra ubicado en el Partido de La Costa, en la provincia de Buenos Aires. Dentro de una de las parcelas se encuentran las instalaciones del Faro San Antonio, el cual fue declarado -junto al área circundante- Monumento Histórico Nacional. En el año 2015 fue señalado con el Emblema Azul, de acuerdo con la Convención de La Haya para la protección de los bienes culturales en caso de conflicto armado.

El área se encuentra recostada en la porción terminal del frente Este del estuario del Río de la Plata, en el extremo Sur de la Bahía de Samborombón y en las cercanías de la Punta Rasa, extremo Norte del Cabo San Antonio. Estos sitios constituyen lugares de importancia para aves migratorias del Neártico durante el verano austral y de especies patagónicas durante el invierno austral, junto con otras especies de aves (como flamencos, rayadores y cisnes), tortugas marinas y otras especies de alto interés.

Su singular ubicación determinada que esta Reserva Natural de la Defensa esté rodeada por un mosaico de áreas protegidas de diferentes categorías y jurisdicciones: el Parque Nacional Campos del Tuyú; las Reservas Naturales Bahía de Samborombón y Rincón de Ajó, ambas provinciales; la Reserva Natural Punta Rasa, perteneciente al municipio de La Costa; la Reserva Municipal Islas de Ajó, perteneciente al municipio de General Lavalle; y los refugios de la Fundación Vida Silvestre Argentina El Carrizal, Los Ñanduces - San Bernardo y La Isolina, además de la Reserva Privada El Erandio.

La RND Faro San Antonio contribuye a la conservación del venado de las pampas (Ozotoceros bezoarticus), especie que declarada Monumento Natural de la provincia de Buenos Aires, y del escuerzo común (Ceratophrys ornata), anfibio asociado a los pastizales y cuyas poblaciones, en franco retroceso, encuentran refugio natural en este sitio.