Dirección Nacional de Investigación
- Grupo de Trabajo Certificación de Pesquerías
- Área de Gestión y Coordinación Técnica
- Área Puerto Madryn
- Programa de Investigación de Aguas Continentales
- Prógrama de Investigación Pesquería de Merluza y fauna acompañante
- Prógrama de Investigación Pesquería de Peces Demersales, Australes y Subantárticos
- Programa de Investigación de Aguas Continentales
- Prógrama de Investigación Pesquería de Peces Pelágicos
- Prógrama de Investigación Pesquerías de Peces Demersales Costeros
- Prógrama de Investigación Pesquerías de Condrictios
- Gabinete de Investigación Hidroacústica
- Gabinete de Investigación determinación de edades de organismos marinos
- Gabinete de Investigación Biomatemática
- Gabinete de Investigación Genética de poblaciones
- Prógrama de Investigación Pesquería de Cefalópodos
- Prógrama de Investigación Pesquería de Langostino
- Prógrama de Investigación Pesquería de Crustáceos Bentónicos
- Prógrama de Investigación Pesquería de Moluscos Bentónicos
- Prógrama de Investigación Dinámica de Ecosistemas y Presiones Antrópicas
- Gabinete de Investigación Ecología Reproductiva
- Gabinete de Investigación Oceanografía Física
- Gabinete de Investigación Zooplancton
- Gabinete de Investigación Salud Ambiental y Microbiologia
- Gabinete de Investigación Ecología Bentónica
- Programa de Investigación Desarrollo de Artes de Pesca y Métodos de Captura
- Programa de Investigación Tecnología, Valorización e Innovación de Productos Pesqueros
- Programa de Investigación Maricultura
- Programa de Investigación Economía Pesquera
- Programa de Investigación Sistema de Información Oceanográfico-Pesquera
- Programa de Investigación Sensoramiento Remoto
- Programa de Investigación Adquisición de Información Biológico-Pesquera
- Gabinete de Muestreo de Desembarque
- Gabinete de Operaciones Científico-Técnicas
- Gabinete de Muestras Permanentes y Transitorias
- Deposito de Drogas y Sustancias Químicas