El Consejo está conformado por presidentes de los diferentes organismos nacionales de Ciencia y Tecnología (OCTs) y por un representante de las universidades por cada una de las siete regiones en las que el Consejo Interuniversitario Nacional (CIN) estructura su actuación, y uno por el Consejo de Rectores de Universidades Privadas (CRUP).

Presidente
Dr. Juan Pablo PAZ – Secretario de Articulación Científico Tecnológica

Secretario Coordinador
Dr. Pablo NUÑEZ – Subsecretario de Coordinación Institucional

Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET)
Presidenta: Dra. Ana María FRANCHI

Comisión Nacional de Energía Atómica (CNEA)
Presidenta: Dra. Adriana Cristina SERQUIS

Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA)
Presidenta: Dra. Susana Beatriz MIRASSOU

Instituto Nacional de Tecnología Industrial (INTI)
Presidente del Consejo Directivo: Abogado Rubén Alberto GENEYRO

Comisión Nacional de Actividades Espaciales (CONAE)
Director Ejecutivo y Técnico: Ing. Raúl KULICHEVSKY

Servicio Geológico Minero Argentino (SEGEMAR)
Presidente: Lic. Eduardo Osvaldo ZAPPETTINI

Instituto Nacional de Desarrollo Pesquero (INIDEP)
Presidente: Dr. Oscar PADIN

Instituto Nacional del Agua (INA)
Presidente: Ing. Juan Carlos BERTONI

Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud (ANLIS)
Director: Dr. Pascual Armando FIDELIO

Consejo Interuniversitario Nacional (CIN)
Presidenta: Prof. María Delfina VEIRAVÉ (UNNE)

Consejo de Rectores de Universidades Privadas (CRUP)
Presidente: Dr. Rodolfo Néstor DE VINCENZI – Rector UAI

Instituto Antártico Argentino
Director: Dr. Walter MAC CORMACK (cargo provisorio)

Administración Parques Nacionales
Presidente del Directorio: Dr. Lautaro Eduardo ERRATCHÚ

Organismos científicos del Ministerio de Defensa que tienen como representante ante el CICYT a la Secretaría de Investigación, Política Industrial y Producción para la Defensa: Instituto de Investigaciones Científicas y Técnicas para la Defensa, Servicio de Hidrografía Naval, Servicio Meteorológico Nacional, Instituto Geográfico Nacional
Lic. Sandra Daniela CASTRO

Instituto Nacional de Prevención Sísmica (INPRES)
Directora Nacional: Dra. Patricia Alvarado

Banco Nacional de Datos Genéticos (BNDG)
Directora General Técnica: Dra. Mariana Herrera Piñero