El PFCA señala a los integrantes del SNCA el curso de las acciones para el corto y mediano plazo, con un enfoque basado en los cinco componentes de todo sistema de control de alimentos. A continuación, se mencionan los objetivos generales que fueron definidos para cada uno de ellos:

I. Gestión del Control de los Alimentos

• Fortalecer un Sistema Federal de Control de Alimentos a través de la integración, coordinación y articulación de sus actividades

II. Legislación Alimentaria

• Promover la actualización permanente del marco normativo, de manera ágil y transparente.
• Generar capacidad oficial en materia de derecho alimentario.
• Fomentar y promover la participación y opinión de los niveles provinciales en los ámbitos de discusión internacionales, referentes a normativa alimentaria

III. Auditoría Alimentaria

• Establecer un enfoque armónico para las actividades de auditoría, basados en una perspectiva peligro-riesgo.

IV. Vigilancia Alimentaria y Laboratorio

• Promover la cooperación y articulación de los laboratorios oficiales a nivel federal.
• Armonizar a nivel federal las estrategias para un sistema integrado de vigilancia alimentaria.
• Armonizar a nivel federal los mecanismos de respuesta ante incidentes alimentarios

V. Información, Educación y Comunicación (IEC)

• Generar y fortalecer la capacidad de los recursos humanos abocados al control de alimentos.
• Proporcionar a los ciudadanos información precisa, confiable y accesible sobre medidas de prevención de ETAs.