El Centro Regional Patagonia Sur comprende los territorios de las provincias de Chubut, Santa Cruz y Tierra del Fuego, Antártida e Islas del Atlántico Sur. Cuenta con tres Estaciones Experimentales Agropecuarias localizadas en Trelew, Río Gallegos y Ushuaia, y una Estación Experimental Agroforestal en la ciudad de Esquel.

Articula tareas con el sector público–privado abordando algunos temas centrales como: el agua, la sostenibilidad de los sistemas productivos (con enfoque en la calidad ambiental, el bienestar animal, la eficiencia productiva, la biodiversidad, la generación de empleo y arraigo, entre otros), los servicios ecosistémicos de todos los ambientes, la producción de alimentos frescos y de calidad y la generación de valor agregado en las diferentes producciones.