La Secretaría Académica del Instituto tiene bajo su responsabilidad la gestión académica de los núcleos de formación y capacitación de acuerdo a los planes de carrera profesional que se determinen para el personal policial y civil de la PSA, como así también de las personas físicas o jurídicas, públicas o privadas abocadas a la seguridad aeroportuaria o a alguna labor conexa. Participa del equipo directivo del ISSA.