El Área Naval Atlántica se creó en marzo de 2000 con la misión de optimizar las funciones de control del mar y entender en todo lo relativo a intereses marítimos.

Su área de responsabilidad se extiende desde el Cabo San Antonio, en la provincia de Buenos Aires, hasta la ciudad de Comodoro Rivadavia.

El comando tiene su asiento en la Base Naval Mar del Plata.

Del área dependen la División Patrullado Marítimo, cuyas unidades son las corbetas ARA “Guerrico” y ARA “Granville”, el aviso ARA "Bahía Agradable", los Patrulleros Oceánicos ARA "Bouchard", ARA "Piedrabuena" , ARA "Storni" y ARA "Contraalmirante Cordero"; la Base Naval Mar del Plata; el Destacamento Naval Comodoro Rivadavia y el Apostadero Naval Puerto Madryn.