Existen diversas causas de contaminación del agua y para distinguirlas en dos grupos podemos mencionar la contaminación natural y la contaminación artificial.

En relación a nuestras actividades, la que nos interesa mencionar es la contaminación artificial, ya que aparece cuando las personas interactuamos con el medio ambiente. En general la asociamos a vertederos de aguas residuales y de las industrias, así como el uso de pesticidas y fertilizantes tóxicos.