La subsecretaría forma parte de la Mesa de Resolución Alternativa de Conflictos Territoriales con los Pueblos Originarios, junto al Instituto Nacional de Asuntos Indígenas (INAI) y la Administración de Parques Nacionales.

Esta misma se conformó en febrero de 2020 bajo un acuerdo entre los Ministerios de Justicia y Derechos Humanos, de Ambiente y Desarrollo Sostenible y Seguridad, y los demás organismos descentralizados que lo componen.

El objetivo: intervenir en los conflictos buscando respuestas consensuadas entre los actores involucrados.

Dicho abordaje se basa en el respeto irrestricto a los derechos de los pueblos originarios al acceso a la tierra y a un modo de vida sustentable, como así lo dispone la Constitución Nacional, los tratados internacionales que forman parte de la misma y la legislación nacional en materia de derecho indígena.